小队突袭是获取秘卷碎片、声望和忍玉的核心PVE玩法，需组队或单人挑战随机生成的副本。该模式分为简单和困难两种难度，困难模式奖励约为普通的两倍，且每日前三次挑战可触发双倍奖励机制。建议优先选择困难模式，但需注意战力匹配与团队协作，避免因单人掉线导致通关失败。战斗中需集中清理小怪，尤其是具备治疗能力的医疗忍者，其威胁可能超过BOSS。部分关卡如觉醒白副本需预判全屏技能冰柱爆炸时机，保持站位稳定以减少伤害。
通关策略上，推荐使用高爆发忍者快速清场，如李洛克或具备远程击退技能的忍者。组队时建议与组织成员固定搭配，通过语音沟通实现聚怪连招，避免各自为战引发的混乱。单人挑战时系统会根据玩家战力调整敌人强度，但需注意副本机制——任意队员阵亡即判定失败。秘卷选择以群体控制或自保类为主，例如千里剑护身可有效应对背后偷袭的小怪。战斗中复活需消耗金币，但失败不扣除挑战次数，可反复尝试直至掌握BOSS机制。
副本流程通常包含四波敌人：首波为小怪群，后续交替出现BOSS带小怪组合，最终同时迎战双BOSS。重点关卡如音忍的阴谋含三阶段BOSS战，需合理分配奥义点与通灵兽技能。面对白等灵活型BOSS时，需避免贪刀追击其无敌状态，转而利用其技能后摇集中输出。战力较低的玩家应优先提升装备与天赋等级，确保基础属性达标后再挑战困难模式。每日挑战次数有限，建议配合金币翻倍功能最大化资源获取效率。
网络环境对体验影响显著，建议在WiFi环境下操作以减少延迟。组织突袭相比随机匹配更易形成战术配合，可提前约定攻击方向与技能衔接顺序。部分地图如鸣人大桥地形狭窄，适合将敌人逼至角落连续控制；而草原类地图则需注意分散型敌人的包抄。秘卷碎片合成需长期积累，稀有碎片在困难模式掉率更高，但需平衡金币消耗与收益比例。
